Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IMPG1Q17R60 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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