Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN1Q16799 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN1Q16799 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN1Q16799 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN1Q16799 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN1Q16799 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN1Q16799 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN1Q16799 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTN1Q16799 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTN1Q16799 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTN1Q16799 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTN1Q16799 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTN1Q16799 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTN1Q16799 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
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