Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NRF1Q16656 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRF1Q16656 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NRF1Q16656 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRF1Q16656 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NRF1Q16656 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRF1Q16656 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRF1Q16656 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NRF1Q16656 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NRF1Q16656 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRF1Q16656 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRF1Q16656 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRF1Q16656 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NRF1Q16656 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NRF1Q16656 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRF1Q16656 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NRF1Q16656 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRF1Q16656 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRF1Q16656 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NRF1Q16656 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NRF1Q16656 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRF1Q16656 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRF1Q16656 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRF1Q16656 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRF1Q16656 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NRF1Q16656 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NRF1Q16656 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRF1Q16656 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRF1Q16656 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NRF1Q16656 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NRF1Q16656 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NRF1Q16656 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRF1Q16656 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRF1Q16656 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
NRF1Q16656 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRF1Q16656 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NRF1Q16656 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms