Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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