Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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SSX1Q16384 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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SSX1Q16384 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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SSX1Q16384 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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SSX1Q16384 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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SSX1Q16384 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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SSX1Q16384 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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SSX1Q16384 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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SSX1Q16384 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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