Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD2Q16342 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD2Q16342 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms