Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3A1Q15459 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3A1Q15459 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
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