Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNN3Q15417 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNN3Q15417 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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