Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PDCD1Q15116 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD1Q15116 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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