Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRD3Q15059 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRD3Q15059 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
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