Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HERC3Q15034 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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