Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PSME4Q14997 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PSME4Q14997 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSME4Q14997 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
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