Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEDD9Q14511 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD9Q14511 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD9Q14511 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
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