Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCARF1Q14162 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SCARF1Q14162 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCARF1Q14162 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCARF1Q14162 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCARF1Q14162 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCARF1Q14162 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SCARF1Q14162 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCARF1Q14162 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCARF1Q14162 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCARF1Q14162 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCARF1Q14162 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SCARF1Q14162 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCARF1Q14162 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SCARF1Q14162 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCARF1Q14162 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SCARF1Q14162 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCARF1Q14162 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCARF1Q14162 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SCARF1Q14162 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SCARF1Q14162 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SCARF1Q14162 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCARF1Q14162 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SCARF1Q14162 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SCARF1Q14162 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCARF1Q14162 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCARF1Q14162 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SCARF1Q14162 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SCARF1Q14162 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCARF1Q14162 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCARF1Q14162 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCARF1Q14162 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SCARF1Q14162 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCARF1Q14162 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SCARF1Q14162 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCARF1Q14162 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCARF1Q14162 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SCARF1Q14162 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCARF1Q14162 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCARF1Q14162 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCARF1Q14162 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCARF1Q14162 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCARF1Q14162 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCARF1Q14162 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCARF1Q14162 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SCARF1Q14162 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCARF1Q14162 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SCARF1Q14162 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCARF1Q14162 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SCARF1Q14162 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCARF1Q14162 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCARF1Q14162 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
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