Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A2Q14055 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COL9A2Q14055 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A2Q14055 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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