Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COL9A3Q14050 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL9A3Q14050 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL9A3Q14050 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
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