Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CKAP5Q14008 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP5Q14008 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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