Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF1Q13905 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
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