Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP1A4Q13733 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP1A4Q13733 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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