Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PEX6Q13608 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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