Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRF5Q13568 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRF5Q13568 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
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