Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NAE1Q13564 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
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