Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAMK2BQ13554 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CAMK2BQ13554 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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