Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD4Q13485 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMAD4Q13485 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms