Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FOXE3Q13461 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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FOXE3Q13461 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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FOXE3Q13461 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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FOXE3Q13461 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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FOXE3Q13461 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXE3Q13461 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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