Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LSAMPQ13449 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSAMPQ13449 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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