Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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