Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IKZF1Q13422 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IKZF1Q13422 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms