Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MSLNQ13421 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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