Protein–RNA interactions for Protein: Q13217

DNAJC3, DnaJ homolog subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC3Q13217 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC3Q13217 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC3Q13217 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms