Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1BQ13112 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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