Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHAF1AQ13111 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAF1AQ13111 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
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