Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK3Q13003 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
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