Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BNIP1Q12981 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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