Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
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FOXD4Q12950 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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FOXD4Q12950 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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FOXD4Q12950 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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FOXD4Q12950 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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FOXD4Q12950 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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FOXD4Q12950 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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FOXD4Q12950 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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FOXD4Q12950 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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FOXD4Q12950 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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FOXD4Q12950 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD4Q12950 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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