Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TP53BP1Q12888 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53BP1Q12888 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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