Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STX4Q12846 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STX4Q12846 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STX4Q12846 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STX4Q12846 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STX4Q12846 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STX4Q12846 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STX4Q12846 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STX4Q12846 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STX4Q12846 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STX4Q12846 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STX4Q12846 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STX4Q12846 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STX4Q12846 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STX4Q12846 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STX4Q12846 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STX4Q12846 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STX4Q12846 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STX4Q12846 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STX4Q12846 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STX4Q12846 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STX4Q12846 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STX4Q12846 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX4Q12846 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX4Q12846 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX4Q12846 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX4Q12846 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX4Q12846 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX4Q12846 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX4Q12846 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX4Q12846 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX4Q12846 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX4Q12846 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX4Q12846 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
STX4Q12846 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX4Q12846 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STX4Q12846 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STX4Q12846 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STX4Q12846 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STX4Q12846 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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STX4Q12846 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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STX4Q12846 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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STX4Q12846 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX4Q12846 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX4Q12846 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX4Q12846 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX4Q12846 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX4Q12846 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX4Q12846 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX4Q12846 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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STX4Q12846 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX4Q12846 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX4Q12846 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX4Q12846 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX4Q12846 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX4Q12846 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX4Q12846 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX4Q12846 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX4Q12846 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX4Q12846 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX4Q12846 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX4Q12846 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX4Q12846 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX4Q12846 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX4Q12846 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX4Q12846 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX4Q12846 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
STX4Q12846 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
STX4Q12846 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX4Q12846 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX4Q12846 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX4Q12846 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX4Q12846 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX4Q12846 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX4Q12846 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX4Q12846 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX4Q12846 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX4Q12846 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX4Q12846 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX4Q12846 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX4Q12846 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX4Q12846 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX4Q12846 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX4Q12846 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX4Q12846 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX4Q12846 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX4Q12846 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX4Q12846 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
STX4Q12846 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
STX4Q12846 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX4Q12846 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX4Q12846 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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