Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF5AQ12840 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF5AQ12840 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF5AQ12840 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF5AQ12840 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms