Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 snR34snR34 203 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 RAD57YDR004W 1383 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 GAL4YPL248C 2646 nt4.88□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 VPS29YHR012W 849 nt4.88□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 MSA2YKR077W 1092 nt4.88□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 YLR036CYLR036C 612 nt4.88□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 YLR125WYLR125W 411 nt4.88□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 YOL050CYOL050C 321 nt4.88□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 OPY2YPR075C 1083 nt4.88□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt4.88□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 THI22YPR121W 1719 nt4.88□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 YMR196WYMR196W 3267 nt4.88□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 THP1YOL072W 1368 nt4.88□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 PHO84YML123C 1764 nt4.87□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 SPR28YDR218C 1272 nt4.87□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 YGR273CYGR273C 525 nt4.87□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 YPL077CYPL077C 723 nt4.87□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 MAK3YPR051W 531 nt4.87□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 SAC1YKL212W 1872 nt4.87□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 MDM34YGL219C 1380 nt4.87□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 LAS21YJL062W 2493 nt4.86□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 SAS10YDL153C 1833 nt4.86□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 YDL109CYDL109C 1944 nt4.86□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 SSA2YLL024C 1920 nt4.86□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 FRE1YLR214W 2061 nt4.86□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 ARC1YGL105W 1131 nt4.86□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 EDC1YGL222C 528 nt4.86□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt4.86□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 PRM9YAR031W 897 nt4.86□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 PEP5YMR231W 3090 nt4.86□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 NUP2YLR335W 2163 nt4.85□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 KIN28YDL108W 921 nt4.85□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 YJL218WYJL218W 591 nt4.85□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 ADD66YKL206C 804 nt4.85□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 TVP38YKR088C 1014 nt4.85□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 YMR085WYMR085W 1299 nt4.85□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt4.85□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 CUS2YNL286W 858 nt4.85□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 YPR015CYPR015C 744 nt4.85□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 ANT1YPR128C 987 nt4.85□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 FES1YBR101C 873 nt4.85□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 ARG4YHR018C 1392 nt4.85□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 TOG1YER184C 2385 nt4.85□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 GAL10YBR019C 2100 nt4.84□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 PAF1YBR279W 1338 nt4.84□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 IWR1YDL115C 1062 nt4.84□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 YHP1YDR451C 1062 nt4.84□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 THI5YFL058W 1023 nt4.84□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 RPN12YFR052W 825 nt4.84□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 MHO1YJR008W 1017 nt4.84□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 YMR114CYMR114C 1107 nt4.84□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 THI12YNL332W 1023 nt4.84□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 YNG1YOR064C 660 nt4.84□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 NHP6AYPR052C 282 nt4.84□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 TOM5YPR133W-A 153 nt4.84□□□□□ -1.63
SEC39Q12745 SUM1YDR310C 3189 nt4.83□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 GAS2YLR343W 1668 nt4.83□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 TDA11YHR159W 1515 nt4.83□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 COQ6YGR255C 1440 nt4.83□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 COQ4YDR204W 1008 nt4.83□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 MRPL7YDR237W 879 nt4.83□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 YGR153WYGR153W 654 nt4.83□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt4.83□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 YIL086CYIL086C 309 nt4.83□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 TRS85YDR108W 2097 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 NOP8YOL144W 1455 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 RVB1YDR190C 1392 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 MED2YDL005C 1296 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 YDR249CYDR249C 1122 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 CAF16YFL028C 870 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 ERG26YGL001C 1050 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 DAN1YJR150C 897 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 YMR315WYMR315W 1050 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 RAD17YOR368W 1206 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 SRB6YBR253W 366 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 VAC7YNL054W 3498 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 AVT3YKL146W 2079 nt4.82□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 SEO1YAL067C 1782 nt4.81□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 TIM21YGR033C 720 nt4.81□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 MRT4YKL009W 711 nt4.81□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 GSP2YOR185C 663 nt4.81□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 HST1YOL068C 1512 nt4.81□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 TSL1YML100W 3297 nt4.8□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 YGR269WYGR269W 327 nt4.8□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 YLF2YHL014C 1218 nt4.8□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 LNP1YHR192W 837 nt4.8□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 YJR012CYJR012C 624 nt4.8□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 UBI4YLL039C 1146 nt4.8□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 YLR374CYLR374C 390 nt4.8□□□□□ -1.64
SEC39Q12745 XKS1YGR194C 1803 nt4.8□□□□□ -1.64
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