Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 YMR320WYMR320W 306 nt7.93□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 SNO4YMR322C 714 nt7.93□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 MDG1YNL173C 1101 nt7.93□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 MIX23YBL107C 591 nt7.93□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 HSP33YOR391C 714 nt7.93□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 HSP32YPL280W 714 nt7.93□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 PEX31YGR004W 1389 nt7.93□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 YER084WYER084W 387 nt7.92□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 RPL24AYGL031C 468 nt7.92□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 MRM2YGL136C 963 nt7.92□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 SFT1YKL006C-A 294 nt7.92□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 ECI1YLR284C 843 nt7.92□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 UTP23YOR004W 765 nt7.92□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 GRX1YCL035C 333 nt7.92□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 NAF1YNL124W 1479 nt7.92□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 KNH1YDL049C 807 nt7.91□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 RPL22BYFL034C-A 369 nt7.91□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 YGR079WYGR079W 1113 nt7.91□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 YGR273CYGR273C 525 nt7.91□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 BET1YIL004C 429 nt7.91□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 ICT1YLR099C 1185 nt7.91□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 FDH2YPL275W 711 nt7.91□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 MRP2YPR166C 348 nt7.91□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 snR30snR30 606 nt7.91□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 RPT2YDL007W 1314 nt7.91□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 MPE1YKL059C 1326 nt7.91□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 ECM10YEL030W 1935 nt7.91□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 TRM12YML005W 1389 nt7.9□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt7.9□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt7.9□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 CKB1YGL019W 837 nt7.9□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 YGL039WYGL039W 1047 nt7.9□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 YGR025WYGR025W 303 nt7.9□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 TRR2YHR106W 1029 nt7.9□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 MMF1YIL051C 438 nt7.9□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 MRP21YBL090W 534 nt7.9□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 YPL014WYPL014W 1146 nt7.9□□□□□ -1.14
NCR1Q12200 FRT1YOR324C 1809 nt7.89□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 HST3YOR025W 1344 nt7.89□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 PER1YCR044C 1074 nt7.89□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 MST27YGL051W 705 nt7.89□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 YGR045CYGR045C 363 nt7.89□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 ASG7YJL170C 630 nt7.89□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 MST28YAR033W 705 nt7.89□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 GSP1YLR293C 660 nt7.89□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 YML122CYML122C 381 nt7.89□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 YBL059WYBL059W 582 nt7.89□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 SUA7YPR086W 1038 nt7.89□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 RPN7YPR108W 1290 nt7.89□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 CNM67YNL225C 1746 nt7.89□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 ENP1YBR247C 1452 nt7.88□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 SRD1YCR018C 666 nt7.88□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 RIM1YCR028C-A 408 nt7.88□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 YDL032WYDL032W 312 nt7.88□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 RRP8YDR083W 1179 nt7.88□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 HOC1YJR075W 1191 nt7.88□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 PET10YKR046C 852 nt7.88□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 CCW12YLR110C 402 nt7.88□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 OSW5YMR148W 447 nt7.88□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 PRX1YBL064C 786 nt7.88□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 RCF2YNR018W 675 nt7.88□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 snR11snR11 258 nt7.88□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 RPO26YPR187W 468 nt7.88□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 UTP18YJL069C 1785 nt7.88□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 RAD7YJR052W 1698 nt7.88□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 PRD1YCL057W 2139 nt7.88□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 VMA13YPR036W 1437 nt7.87□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 MPH3YJR160C 1809 nt7.87□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 SLF1YDR515W 1344 nt7.87□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 MRH1YDR033W 963 nt7.87□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 FUR1YHR128W 651 nt7.87□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 AIM46YHR199C 933 nt7.87□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 MAM33YIL070C 801 nt7.87□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 YJL215CYJL215C 360 nt7.87□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 YNR071CYNR071C 1029 nt7.87□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 SCO1YBR037C 888 nt7.87□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 TGL1YKL140W 1647 nt7.87□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 PES4YFR023W 1836 nt7.87□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 TIM54YJL054W 1437 nt7.86□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 MED1YPR070W 1701 nt7.86□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 ERP3YDL018C 678 nt7.86□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 YDL057WYDL057W 987 nt7.86□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 SRB7YDR308C 423 nt7.86□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 FPR2YDR519W 408 nt7.86□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 DFG10YIL049W 762 nt7.86□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 RFC2YJR068W 1062 nt7.86□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 GPX1YKL026C 504 nt7.86□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 YKL169CYKL169C 384 nt7.86□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 SNN1YNL086W 309 nt7.86□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 NSG2YNL156C 900 nt7.86□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 YLR173WYLR173W 1827 nt7.86□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 VRP1YLR337C 2454 nt7.85□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 YDR269CYDR269C 324 nt7.85□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 YDR271CYDR271C 372 nt7.85□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 RTA1YGR213C 954 nt7.85□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 CAR2YLR438W 1275 nt7.85□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 ATG3YNR007C 933 nt7.85□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 RUP1YOR138C 2016 nt7.85□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 MLF3YNL074C 1359 nt7.84□□□□□ -1.15
NCR1Q12200 YER152CYER152C 1332 nt7.84□□□□□ -1.15
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