Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CPSF1Q10570 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CPSF1Q10570 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
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