Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF543Q08ER8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF543Q08ER8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms