Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 SEC12YNR026C 1416 nt5.33□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 SDA1YGR245C 2304 nt5.33□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 DOS2YDR068W 933 nt5.33□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 RML2YEL050C 1182 nt5.33□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 VPS29YHR012W 849 nt5.33□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 RSM26YJR101W 801 nt5.33□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 NIT3YLR351C 876 nt5.33□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.33□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 GLO4YOR040W 858 nt5.33□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 SMA1YPL027W 738 nt5.33□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 DED81YHR019C 1665 nt5.32□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 AVO1YOL078W 3531 nt5.32□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 LUC7YDL087C 786 nt5.32□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 MNN10YDR245W 1182 nt5.32□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 HIM1YDR317W 1245 nt5.32□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YHB1YGR234W 1200 nt5.32□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt5.32□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 RPC17YJL011C 486 nt5.32□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YJL220WYJL220W 453 nt5.32□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YKL071WYKL071W 771 nt5.32□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 TEX1YNL253W 1269 nt5.32□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 MDY2YOL111C 639 nt5.32□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 CKA2YOR061W 1020 nt5.32□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YOR169CYOR169C 465 nt5.32□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YPL068CYPL068C 882 nt5.32□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 snR19snR19 568 nt5.32□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 snR3snR3 194 nt5.32□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 GRX1YCL035C 333 nt5.32□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 DRN1YGR093W 1524 nt5.32□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 SLM5YCR024C 1479 nt5.32□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 HSE1YHL002W 1359 nt5.31□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 CAB1YDR531W 1104 nt5.31□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 EST3YIL009C-A 546 nt5.31□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt5.31□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 PAU17YLL025W 375 nt5.31□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YLR049CYLR049C 1287 nt5.31□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.31□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 GSP2YOR185C 663 nt5.31□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 SRL4YPL033C 846 nt5.31□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 ARL3YPL051W 597 nt5.31□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 POP4YBR257W 840 nt5.31□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 RBA50YDR527W 1320 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 PRM2YIL037C 1971 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 OCA4YCR095C 1089 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 BUD30YDL151C 582 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YDR290WYDR290W 330 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 GRX4YER174C 735 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 DDI2YFL061W 678 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YGR219WYGR219W 342 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YJR085CYJR085C 318 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 ECM1YAL059W 639 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 ORM2YLR350W 651 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YBL062WYBL062W 381 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 RUF5-1RUF5-1 710 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 DDI3YNL335W 678 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 RUF5-2RUF5-2 710 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 TOM5YPR133W-A 153 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 CBP6YBR120C 489 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YBR134WYBR134W 402 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 PBP2YBR233W 1242 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 CNA1YLR433C 1662 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 NTH2YBR001C 2343 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 SSZ1YHR064C 1617 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 GRS1YBR121C 2004 nt5.3□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 RAD57YDR004W 1383 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YER137C-AYER137C-A 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YER159C-AYER159C-A 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YJR026WYJR026W 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YJR028WYJR028W 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YAR010CYAR010C 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YML040WYML040W 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YML045W-AYML045W-A 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YMR051CYMR051C 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 ACF2YLR144C 2340 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 RSM10YDR041W 612 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 RNH202YDR279W 1053 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 LST7YGR057C 729 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 RPS0BYLR048W 759 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 YMR084WYMR084W 789 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 CPR8YNR028W 927 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 NHP6AYPR052C 282 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 HOS1YPR068C 1413 nt5.29□□□□□ -1.56
SGO1Q08490 RAT1YOR048C 3021 nt5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.1 ms