Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PSME1Q06323 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PSME1Q06323 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PSME1Q06323 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms