Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 YLR283WYLR283W 945 nt4.01□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 LYS2YBR115C 4179 nt4.01□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 SLD2YKL108W 1362 nt4.01□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 FAS2YPL231W 5664 nt4□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 NOC2YOR206W 2133 nt4□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 CAB1YDR531W 1104 nt4□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 RPL24AYGL031C 468 nt4□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 SWP1YMR149W 861 nt4□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 YMR315WYMR315W 1050 nt4□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 YHR177WYHR177W 1362 nt4□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 GPI18YBR004C 1302 nt3.99□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 VHS3YOR054C 2025 nt3.99□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt3.99□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt3.99□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt3.99□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt3.99□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt3.99□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt3.99□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt3.99□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 YHR145CYHR145C 357 nt3.99□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 MID2YLR332W 1131 nt3.99□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 SSO1YPL232W 873 nt3.99□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 NCE102YPR149W 522 nt3.99□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 PWR1PWR1 941 nt3.99□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 SRB6YBR253W 366 nt3.99□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 SKM1YOL113W 1968 nt3.99□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 TPA1YER049W 1935 nt3.99□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 MAG2YLR427W 2013 nt3.99□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 YCF1YDR135C 4548 nt3.98□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 SNF2YOR290C 5112 nt3.98□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 HSP42YDR171W 1128 nt3.98□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 YER145C-AYER145C-A 438 nt3.98□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 SRB5YGR104C 924 nt3.98□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 YIL165CYIL165C 360 nt3.98□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 MRPL39YML009C 213 nt3.98□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 OAF1YAL051W 3144 nt3.98□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 MCP2YLR253W 1710 nt3.98□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 YML020WYML020W 1995 nt3.97□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 RPL8AYHL033C 771 nt3.97□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 SPS18YNL204C 903 nt3.97□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 HOS3YPL116W 2094 nt3.97□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 DPB2YPR175W 2070 nt3.97□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 GIP4YAL031C 2283 nt3.97□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 FRE7YOL152W 1863 nt3.96□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 ATG18YFR021W 1503 nt3.96□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 YIL001WYIL001W 1542 nt3.96□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 LAS1YKR063C 1509 nt3.96□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 SNF11YDR073W 510 nt3.96□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 VPS29YHR012W 849 nt3.96□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 LDB18YLL049W 540 nt3.96□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 ORM2YLR350W 651 nt3.96□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 SHE1YBL031W 1017 nt3.96□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 SIW14YNL032W 846 nt3.96□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 LPL1YOR059C 1353 nt3.96□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 APM4YOL062C 1476 nt3.96□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 NUG1YER006W 1563 nt3.96□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 YDL027CYDL027C 1263 nt3.95□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 NMA1YLR328W 1206 nt3.95□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 RDL1YOR285W 420 nt3.95□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 NUP133YKR082W 3474 nt3.94□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 ADK2YER170W 678 nt3.94□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 YHR214WYHR214W 612 nt3.94□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 MAP1YLR244C 1164 nt3.94□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 YAR066WYAR066W 612 nt3.94□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 SUI1YNL244C 327 nt3.94□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 OM14YBR230C 405 nt3.94□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 YLR152CYLR152C 1731 nt3.94□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 VMA1YDL185W 3216 nt3.94□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 ATG2YNL242W 4779 nt3.93□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 BRE4YDL231C 3378 nt3.93□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 HMG1YML075C 3165 nt3.93□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 PIM1YBL022C 3402 nt3.93□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 TRM8YDL201W 861 nt3.93□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 WSS1YHR134W 810 nt3.93□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 YLR407WYLR407W 687 nt3.93□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 ARG8YOL140W 1272 nt3.93□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 PZF1YPR186C 1290 nt3.93□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 STP22YCL008C 1158 nt3.93□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 SRO7YPR032W 3102 nt3.93□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 JHD2YJR119C 2187 nt3.93□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 GAL11YOL051W 3246 nt3.93□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 MCM2YBL023C 2607 nt3.92□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 RTC1YOL138C 4026 nt3.92□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 RPL14AYKL006W 417 nt3.92□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 PRP9YDL030W 1593 nt3.92□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 ECM22YLR228C 2445 nt3.92□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 MMT1YMR177W 1533 nt3.91□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 HCM1YCR065W 1695 nt3.91□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt3.91□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 ISY1YJR050W 708 nt3.91□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 DBR1YKL149C 1218 nt3.91□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 RFU1YLR073C 603 nt3.91□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 YBL059WYBL059W 582 nt3.91□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 CIN5YOR028C 888 nt3.91□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 YPR174CYPR174C 666 nt3.91□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 NOP8YOL144W 1455 nt3.91□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 TCO89YPL180W 2400 nt3.91□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 RPO31YOR116C 4383 nt3.91□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 CDC14YFR028C 1656 nt3.9□□□□□ -1.78
NEJ1Q06148 NOP58YOR310C 1536 nt3.9□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28 ms