Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF11Q05519 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms