Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCZQ05513 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCZQ05513 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms