Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD164Q04900 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD164Q04900 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD164Q04900 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD164Q04900 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD164Q04900 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD164Q04900 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD164Q04900 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD164Q04900 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD164Q04900 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD164Q04900 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD164Q04900 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CD164Q04900 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD164Q04900 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD164Q04900 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CD164Q04900 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD164Q04900 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD164Q04900 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD164Q04900 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD164Q04900 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD164Q04900 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD164Q04900 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD164Q04900 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD164Q04900 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CD164Q04900 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD164Q04900 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD164Q04900 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD164Q04900 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD164Q04900 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD164Q04900 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CD164Q04900 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD164Q04900 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CD164Q04900 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD164Q04900 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD164Q04900 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD164Q04900 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD164Q04900 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD164Q04900 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD164Q04900 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD164Q04900 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD164Q04900 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD164Q04900 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD164Q04900 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CD164Q04900 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD164Q04900 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CD164Q04900 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD164Q04900 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD164Q04900 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD164Q04900 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD164Q04900 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD164Q04900 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD164Q04900 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD164Q04900 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD164Q04900 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD164Q04900 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD164Q04900 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD164Q04900 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD164Q04900 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD164Q04900 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD164Q04900 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD164Q04900 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD164Q04900 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD164Q04900 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD164Q04900 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD164Q04900 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD164Q04900 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CD164Q04900 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD164Q04900 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CD164Q04900 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD164Q04900 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD164Q04900 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD164Q04900 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD164Q04900 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD164Q04900 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD164Q04900 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD164Q04900 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD164Q04900 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD164Q04900 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms