Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSBP1Q04837 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms