Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCQQ04759 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms